Elk gebouw is uniek en heeft zijn eigen erfgoedwaarden, daarom is elk erfgoedonderzoek altijd maatwerk. De inhoud van elke studie wordt aangepast aan de vraagstelling van het onderzoek, de beschikbare bronnen en de aard en omvang van het gebouw of site.

Mar Jaen maakt zowel een bouwhistorische studie, erfgoednota, CHE-rapport, inventaris, slooprapport als beheersplan op. Het erfgoedonderzoek, dat grotendeels opgebouwd is als een bouwhistorisch onderzoek, zal telkens volgens onderstaande methodologie opgestart worden.

• – Naargelang de opdracht wordt gestart met een in-situ-onderzoek, want het gebouw/site is altijd primaire bron.  
•  
• – Aan de hand van een uitgebreide fotoreportage en observatie van het ruimteconcept, materialen en structuren worden de erfgoedobjecten geïnventariseerd en een beeld van de bouwfysische toestand opgemaakt. Indien er geen erfgoedwaardige elementen aanwezig zijn, worden deze ook in kaart gebracht.  
•  
• – Verder wordt een literatuur- (o.a. recente en contemporaine vakliteratuur, tijdschriften, onuitgegeven bronnen) en archiefonderzoek (o.a. gemeente-/stads-/privé-/rijksarchief en kadaster) uitgevoerd. Dit wordt steeds aangevuld met een iconografisch bronnenonderzoek (o.a. kaarten, plannen, ontwerptekeningen, foto’s).
•  
• – De onderzoeksresultaten van de verschillende bronnen worden in een begrijpbare tekst verwerkt. De tekst wordt chronologisch opgebouwd en richt zich op de historiek van het gebouw/site in combinatie met de resultaten van het in-situ-onderzoek. Naderhand worden de verschillende bouwfasen op een plan van bestaande toestand in kleur aangeduid.
•  
• – Op basis van deze onderzoeksresultaten wordt een conclusie opgemaakt waarbij de erfgoedwaarden van het gebouw/site gedefinieerd worden. Daaraan worden aanbevelingen en verder erfgoedadvies gekoppeld.